على إثر سلسلة من حالات استهداف الكنائس وأماكنِ تجمُّع المسيحيين مِن قِبل المجموعات التكفيرية، إضافة إلى اندلاع عدد من حوادث الاعتداءات الطائفية؛ صدر في 23أبريل 2018 قرارٌ بإنشاء المجلس الأعلى لمواجهة الإرهاب  والتطرّف، والذي يكون تشكيله برئاسة رئيس الجمهوريّة، وعضويّة كلٍّ من رئيس مجلس النواب، ورئيس مجلس الوزراء، وشيخ الأزهر الشريف، وبابا الإسكندريّة بطريرك الكرّازة المرقسيّة، والقائد العام للقوّات المسلّحة: وزير الدفاع والإنتاج الحربيّ، ووزراء: الأوقاف، والتضامن الاجتماعيّ، والشباب والرياضة، ووزير الخارجيّة، والداخليّة.

أنشِئت لجنة فرعية تحت مسمَّى اللجنــة العليــا لمواجهــة الأحداث الطائفيــة، بقــرار جمهــوري صدر في 30 كانون الأول/ديسمبر 2018، لوضــع السياســات، وتنفيــذ الخطــط التــي تكفــل زيــادة الوعــي بمخاطــر الفتنــة الطائفيــة، وتعزيــز التســامح الدينــي والتعامــل مــع الحــوادث الطائفيــة الفرديــة، وتنفيــذ الأنشطة التنمويــة فــي المناطــق التــي توجــد فيهــا بــؤر للتوتــر الطائفــي.

أيضًا أعلنت وزارة التضامن الاجتماعي في 18 ديسمبر 2020، البدءَ بتنفيذ خطة “تعزيز قيم وممارسات المواطنة” في ٤٤ قرية بمحافظة المنيا، وهي أكثر القرى فقرًا، وأكثرها تضررًا من الأحداث الطائفية، وذلك بالتعاون والتنسيق مع اللجنة العليا لمواجهة الأحداث الطائفيّة، وذلك بالتعاون والتنسيق مع اللجنة العليا لمواجهة الأحداث الطائفيّة. ثمّ إنّها أكّدت أنّ الوزارة تدعم العمل الأهلي لمواجهة التيّارات المتشدّدة دينيًّا، وكافّة أشكال العنف والتمييز الاجتماعيّ. كما تقوم الجمعيّات بتنفيذ عدّة أنشطة، وتدخّلات اجتماعيّة، واقتصاديّة، وثقافيّة، لنشر قيم التسامح، وقبول الآخر.

بالإضافة إلى ذلك، أطلقت وزارة الشباب والرياضة في أوّل نوفمبر ٢٠٢٣، بالتعاون مع مرصد الأزهر لمكافحة التطرّف بمشيخة الأزهر الشريف، الموسم الثالث من برنامج «نحو رؤية شبابيّة لمجابهة التطرّف» بمشاركة الكوادر الطلّابيّة من جامعة قناة السويس، والذي استمرّ حتّى يوليو ٢٠٢٤. بينما نظّم المجلس القَوميّ للمرأة، بالتعاون مع مؤسَّستَي: سيف ايجيبت وباث فايندر، في مايو ٢٠٢٣، معسكرًا تدريبيًّا للواعظات، والراهبات، وخادمات الكنائس، لدمج القيادات الدينيّة في قضايا مناهضة العنف ضدّ المرأة.